峨眉派的源起可以追溯到明代中叶，唐顺之在《荆川先生文集》中有所记载，其中包括了一首《峨眉道人拳歌》，描绘了一个神奇的武术家如何运用其拳法在自然环境中自由自在地变化和战斗。关于峨眉派的具体历史，据传祖师是一位善于技击且能研各家拳法的道姑，她后来入佛门，但仍然创造了一套独特的武功，这套武功最初被称为“玉女拳法”，后因与佛教圣地“峨眉山”的相似而得名。

从宗教角度看，峨眉派既有僧也有道，以道姑为主。在金庸的小说《倚天屠龙记》中，郭靖的大女儿郭襄因为爱慕杨过而云游四海，并在途中学习到了九阳真经，从而创立了峨嵋派。随着时间的推移，峨眉派逐渐成为了武林中的著名门派，其招式如一面花、斜插一枝梅等都带有女性色彩，而兵器如玉女簪则是由女子发簪变来的。

南宋末年，郭靖与黄蓉力守襄阳，其次女郭襄开始了她寻找杨过的旅程。在此期间，她拜访少林无色禅师，并遇到了昆仑派祖师何足道。之后，无色创立了少林九阳功，而张君宝则开创了武当。而最终，在四十岁时，郭襄大彻大悟，在出家后的她开创了峨嵋派。

风陵师太成为第二代掌门人的时候，与明教高手杨逍斗争不分胜负，最终将倚天剑失落并落入官府之手。但风陵传衣钵给灭绝师太后，她重新抢回倚天剑，使得峨嵋声誉日隆，最终成为与少林、武当、昆仑齐名的大门派之一。