少林洪门武学源远流长，其根基可追溯至隋末唐初，当时，少林武僧们基于唐高祖李渊所封的十三大将——“十三太保”和唐太宗李世民对寺中武僧的御封——“少林十三太保”，精心研究、总结并创造出独特的武艺，这便是著称的“少林十三太保功”。后来，在太平天国时期，洪世成（洪秀全侄子，因战败而出家）在寺中修行十二年后归隐俗界，他成为首位传承这一武术于民间的人物，并不断创新，最终形成了一套独立于众派之外的独特风格，故名为“少林洪门武功”。其後，掌门人一职先后由孙老常、何传福、张路子、马振峰及陈飞龙等人担任。

该派深崇内外兼修，以刚柔相济为核心理念。它强调只有内力充沛才能展现身手坚强；拳械则要求既要有柔韧性又要有劲力，同时拳式要舒展大方而不失猛烈；技击方面则注重攻防两端均衡，要巧妙打击敌人，同时也有硬碰硬的一面。

这套拳法包含了多种内容，如养生内功与气功训练，以及童子功练习，还包括各种独特的手足技术如鹰爪拳和醉拳。此外，还有一系列武器技能，如梅花刀、三节棍和梢子棍等，以及擒拿技巧和反擒拿法。最特别的是，它还融入了医术知识，使得学习者能够在实战中应用这些知识以达到更好的效果。这使得少林洪门成为一种综合性的武术系统。